Сакен Исабеков родился 10 февраля 1980 года в Москве. Окончил университет им. Д.А. Кунаева по специальности "юриспруденция".
С 2001 по 2003 год служил в воинских частях Республиканской гвардии РК.
С 2003 по 2021 год служил на различных офицерских и руководящих должностях в Службе государственной охраны Республики Казахстан.
С 2021 по 2022 год работал заместителем начальника Службы государственной охраны, начальником Службы охраны президента РК.
С 6 января 2022 года занимает должность начальника Службы государственной охраны РК.